1.采用活性炭，通過物理方法將有機分子吸附到活性炭的孔隙中。該方法是一種安全性能高的有機物去除方法和使用方法。但不適合直徑大于或類似活性炭的有機物，仍是經濟效益差的資源。2.利用反滲透去除有機物去除率高，尤其是分子量大于200的有機物去除率可達90%以上。這種方法和活性炭吸附法多用于溶解有機物。
3.采用強氧化法，可用次氯酸鈉等強氧化劑氧化分解有機物。
4.強化混凝法可以提高水中有機物的去除率。但是混凝劑的選擇會影響有機物的去除率。一般來說，無機混凝劑的強化混凝效果較好。此外，混凝劑投加量過小，混凝效果不理想，但投加量過多會導致膠體再穩定，水的pH值也是影響強化混凝的主要因素。這種方法主要用于去除懸浮或膠體有機物。
5.采用生化法，目前廣泛用于去除有機物。